宋一江一的掌控能力极强，梁山好汉几乎每一个都在他的掌握之中，他对不同的人用不同的方法。吴用也不例外，他不是宋一江一的对手，但这两位基本上能达到一种平衡，否则便没有办法合作下去。
前面说过，吴用与晁盖的关系是：吴用一直暗中掌控着晁盖，吴用十分了解晁盖，晁盖并不了解吴用，不过在宋一江一上山之前，他们的关系基本上能达到某种平衡，吴用对晁盖的一操一控至少没有暴露出来。
宋一江一上山以后，形势发生了变化。首先，宋一江一带上山的人马显然比晁盖的原班人马要多。再次，梁山屡次对外征战，都是宋一江一带领的，这意味着他掌握了军权，军权才是真正的权利，晁盖的山寨之主形同虚设。就象傀儡皇帝一样，甚至他还 不如傀儡皇帝，皇帝再不济还 有可能退位做个太上皇，至少可以保命养老，晁盖其实没有任何退路。
当过兵的人都知道，战友的情谊往往比其它的情谊更加牢固一些，尤其是曾在战场上同生共死的战友，其情谊更是牢不可破。在屡次带兵征战的过程中，宋一江一与这些好汉们很自然的就建立起了关系，这种关系不是靠着空谈就可以得来的。军中的赏罚、奖励更会刺激着好汉们争先恐后地聚拢在宋一江一周围，他们渐渐的都会意识到，只有跟定了宋一江一，才能立功受赏，才能有前途，才不会落单。简单地总结一下，就是：打仗的过程其实是建立关系的过程。你经常用着的人才有可能忠于你。
最后的结果是：梁山上的天平已发生了严重的倾斜。
形势发生了这么大的变化，吴用看在眼里，他必须得做出选择，否则有站错队的危险。绝不是说梁山少不了他这个军师，不是还 有个公孙胜和神机军师朱武呢吗？随时都可以取代他。
实际上，梁山招安以后，在征辽及征方腊的过程中，吴用好象没有派上多大用场，倒是神机军师朱武有过一些上佳的表现。吴用的智谋只在梁山时期有些表现，其中还 有一些非常恶劣的坏点子，比如赚卢俊义上山，让李逵杀死小衙内等等，都恶劣之极，他出的好主意其实不多。
所以为了他自己的前途着想，也必须得作出选择，他并不是愿意选择宋一江一，只是他斗不过宋一江一而已。他最终放弃了晁盖追随了宋一江一。
现在，就说说他和宋一江一的关系。
宋一江一可没有晁盖那样易于掌握，吴用与宋一江一之间一奸一猾程度不相上下，他们彼此是了解的，各自心知肚明，各取所需，各有所图，所以才能达成一致。
吴用处处在显聪明，宋一江一处处在显愚笨。自古以来，所有的军师都喜欢显示自己的聪明，否则，何以服人呢？他们就是吃这碗饭的，所以，军师们各个聪明外露，吴用也不例外。如果连这点聪明都没有，人家还 要他做什么？宋一江一反之，总是表现的忠厚愚笨，但他不是真的笨，他利用吴用的聪明来替他背一些黑锅，吴用干出来的很多聪明的坏事，本来也是宋一江一的意思，例如赚卢俊义上山，指使李逵杀死小衙内，表面上看是吴用的主意，其实也是宋一江一的意思，只是宋一江一很会装憨卖傻，让吴用替他背了黑锅。吴用不是不明白，只是他也没有选择，因为他必须得表现他的聪明，否则愧对了他的智多星之名，也不能让宋一江一满意。
他们各有所图，各取所需。吴用心想：你喜欢装傻就装吧，我正好施展我的聪明智慧。宋一江一心想：你就好好耍你的聪明吧，我正好装傻。所以，他永远是个忠厚大哥的形象。
吴用曾有几次越权行一事，也就是说未经宋一江一同意私自做了决定。第七十二回《柴进簪花入禁院 李逵元夜闹东京》写李逵等元夜大闹东京，杀出城后，不见了宋一江一、柴进和戴宗，原来是军师吴用差五员虎将引领带甲马军一千骑，接到了宋一江一等。书中写道：原来军师吴用已知此事，定教大闹东京。因为只有大闹东京，才能引起皇帝的关注。也就是说吴用派来一千人马是要大闹东京的，只是他来晚了一步，东京已经被李逵等闹过了。吴用做这个事，是不是违了宋一江一的本意呢？当然不是，宋一江一也要大闹东京，只是他不明说。如果他不想闹东京，就真的不必带李逵了，更不该带李逵到李师师家里，还 把李逵介绍给李师师，他带上李逵就是要闹东京的。吴用和宋一江一的意思是一致的，只是一个明着做，一个暗着做。
另外，阮小七偷换御酒那一回，应该也是有吴用的授意，否则，阮小七哪来的胆子，梁山上就没有法度和纪律吗？想必梁山上纪律也是严明的，否则宋一江一怎么管理这108个魔君。再说，梁山上天天吃肉喝酒，他哪里欠那么一点酒喝。
吴用总是越权行一事，宋一江一却没有表示出半点不高兴，他是真忠厚真软弱真不争吗？那他怎么能统御梁山上108条硬汉子呢？他为什么允许吴用挑战他的权威，吴用又为什么敢于挑战宋一江一的权威呢？事实上吴用做的事情本来就是宋一江一的意思而已。他太了解宋一江一了。
在征方腊的过程中，兄弟们一个接一个战死，每死一个兄弟宋一江一就哭晕过去一回，连吴用也看不下去他那假模假式，明显的有些不耐烦。
吴用和宋一江一都很一奸一猾，但吴用一奸一诈的真，宋一江一奸一诈的伪。